Hyper Sudoku — auch Windoku genannt — spielt sich wie klassisches Sudoku, mit vier zusätzlichen 3×3-Bereichen. Jede Zeile, jede Spalte und jedes 3×3-Feld enthält weiterhin die Ziffern 1 bis 9 genau einmal; zusätzlich enthält jeder der vier Hyper-Bereiche (jeweils eine Zelle aus jeder Ecke des Bretts eingerückt) ebenfalls alle Ziffern 1 bis 9.

Die Hyper-Bereiche sind mit durchgezogenen Korallenrahmen markiert. Sie überlappen mit den Standard-3×3-Feldern, sodass eine Ziffer in einem Hyper-Bereich gleichzeitig zwei Bereiche einschränkt.

Die Zusatzregel ist stärker, als sie wirkt. Ein Hyper-Bereich überspannt die Grenze zwischen zwei Standard-Feldern, sodass eine Ziffer, die durch eine Zeilen- oder Spaltenkollision aus der einen Hälfte ausgeschlossen ist, in die andere Hälfte gezwungen wird — selbst wenn die Standard-Feld-Suche das nicht offensichtlich gemacht hat. Wenn ein Rätsel beim Standard-Scannen stockt, liegt der nächste Schluss meist in den Hyper-Bereichen.

Mittlere Rätsel bringen Situationen, in denen reines Durchsuchen stockt und etwas tieferes Denken gefragt ist: versteckte Einzelne in einer Zeile oder einem Feld, zeigende Paare und gelegentlich zweistufige Ableitungen.

Notizen werden hier nützlich. Trage für eine kniffelige Zeile alle Kandidaten ein und suche dann nach Ziffern, die nur in eine Zelle passen.